V šmarnogorskih bregovih in grapah živi različna divjad. Najštevilčnejša je srnjad, ki se pred obiskovalci gore in potepuškimi psi skriva v manj prehodnih delih. Mala divjad, zlasti fazan in poljski zajec, sta že tako razredčena, da ju tukaj štejejo za ogrožena. Na Šmarni gori najdete še veverico, polha, lisico, kune, dihurja, ter vrsto ptic. Precej je še jerebic, kanj in skobcev.